تحلیل رفتار dna در گذر از ریز ساختارها بر اساس معادله فوکر-پلانک و مدل سد آنتروپی
نویسندگان
چکیده
حرکت مولکولهای dna از میان یک آرایه شش وجهی از ستونهای ریز تحت میدان الکتریکی یکنواخت به عنوان یک فرآیند فوکر-پلانک که متاثر از مدل سدآنتروپی نیز هست به وسیله کامپیوتر شبیه سازی شد و معادله فوکر-پلانک حاکم بر رفتار آنها به روش شبیه سازی عددی دینامیک براونی، با روش اولر حل شد. میانگین زمانی سرعت، واریانس و میانگین < x2 > در یک زمان معین، برای مولکولهای مختلف dna در شرایط مختلف محاسبه و با نتایج دیاگرام فاز حاصل از نتایج قبلی ما [۱۹] مقایسه شد. با مقایسه این نتایج توانستیم به فیزیک حاکم بررفتار dna در رژیمهای مختلف پی ببریم. روشن شد که در رژیم -۱ دیاگرام فاز مذکور (dnaهای کوچک در میدانهای ضعیف)، با یک پدیده پخش خالص مواجه هستیم، در رژیم -۳ (dnaهای بزرگ در میدانهای قوی ) فیزیک حاکم بر رفتار dna، مدل سدآنتروپی است و در رژیم-٢ ( dnaهای با طول متوسط در میدانهای متوسط و نسبتا قوی [۱۹]) که رژیم پیچیدای است با یک پدیده پخش تحت نیرو روبرو هستیم که بی تأثیر از مدل سد آنتروپی نیز نیست.
منابع مشابه
تحلیل رفتار DNA در گذر از ریز ساختارها بر اساس معادله فوکر-پلانک و مدل سد آنتروپی
We considered the motion of DNA molecules through a hexagonal array under uniform electric fields as a Fokker-Planck process which is affected by the entropic barriers and we have simulated this motion by computer. We solved the Fokker-Planck equation with numerical simulation of the Brownian dynamics by the Euler method. For different DNA molecules, under different physical conditions, the mea...
متن کاملاسکویید dc ، انکویید و نانواسکویید ”پیش‌بینی‌‌رفتارها با استفاده از حل تحلیلی معادله فوکر- پلانک“
By defining the loop inductance for NQUID and considering sinusoidal Fourier series for the current-phase relations of its nanowires and replacing two Langevin equations with one two-dimensional Fokker-Planck equation, we have obtained analytical relations for the characteristics of the asymmetric NQUID. On the other hand for DC SQUIDs and nanoSQUID, we have to consider simultaneously the effe...
متن کاملجوابهای وابسته به زمان معادلات فوکر- پلانک غیر خطی مربوط به توابع دلخواه از آنتروپی تسالیس
The nonlinear Fokker-Plank equations can be related to generalized entropies. We investigate the stationary solutions of Fokker- Plank equations which are related to entropies defined as arbitrary functions of Tsallis entropy. Also the transient solutions of the equations are determined for linaer drifts.
متن کاملاسکویید dc ، انکویید و نانواسکویید ”پیش بینی رفتارها با استفاده از حل تحلیلی معادله فوکر- پلانک“
ما با تعریف القاییدگی حلقه انکویید، در نظر گرفتن بسط فوریه سینوسی برای رابطه جریان- فاز هر نانوسیم آن ، و جایگزین کردن یک معادله فوکر- پلانک دو بعدی به جای دو معادله لنجوین، روابط تحلیلی برای رفتارهای انکویید نامتقارن به دست آورده ایم. از طرف دیگر علاوه بر مورد انکویید، در مورد اسکوییدهای dc و نانواسکویید هم، در نظرگرفتن همزمان آثار انحراف رابطه جریان- فاز از شکل سینوسی، آثار افت وخیزها و نوفه ...
متن کاملمعادلات فوکر-پلانک غیر خطی وابسته به آنتروپی های تعمیم یافته
مکانیک آماری بولتزمن-گیبس بر پایه ی انتروپی sbg بنا شده است این آنتروپی برای برخی سیستم ها توصیف دمایی موفقی دارد? مانند سیستم هایی که شامل بر همکنش های کوتاه برد و فرآیند های مارکوین هستند اما برای سیستم هایی که دینامیک میکروسکپی پیچیده تری دارند مفهوم آنتروپی باید تعمیم یابد. در این پایان نامه به طور خلاصه تعریف نتایج و کاربرد های آنتروپی تسالیس را که تعمیمی از آنتروپی معمول بولتزمن –گیبس می...
15 صفحه اولمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
پژوهش فیزیک ایرانجلد ۹، شماره ۲، صفحات ۱۸۵-۱۹۳
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023